טקסטים נוספים מתחלפים

מתוך Genopedia - פרופ' מוטי שוחט

עובר ממין נקבה שנמצא עם שינוי c.2792dup בגן NRXN1. זה מורש מאמא בריאה לחלוטין. מה הסיכון שלו לסבול מאוטיזם או פיגור שכלי?

שינויים הטרוזיגוטיים בגן NRXN1 מאופיינים בחדירות נמוכה (incomplete penetrance), כלומר רוב הנשאים אינם מפתחים הפרעות התפתחותיות משמעותיות. העובדה שהאם בריאה לחלוטין תומכת בכך, אך אינה מבטלת את הסיכון לעובר.

הסיכון לאוטיזם או פיגור שכלי

בקבוצות שנבדקו קלינית (כלומר, ילדים שהופנו לבדיקה גנטית בגלל תסמינים), שינויים אקסוניים הטרוזיגוטיים ב-NRXN1 נמצאו קשורים ל: [1]

פיגור שכלי בינוני עד חמור: 77-92%

הפרעות בספקטרום האוטיסטי: 43-70%

אפילפסיה: 14-53%

היפוטוניה: 38-47%

ADHD: 9-41%

עם זאת, נתונים אלה אינם משקפים את הסיכון האמיתי מכיוון שהם מבוססים על אוכלוסייה שכבר הופנתה לבדיקה בגלל תסמינים קליניים (ascertainment bias).

נתונים חשובים על חדירות

מחקרי מקרה-ביקורת מצאו ש: [1]

שינויים אקסוניים ב-NRXN1 נמצאים ב-0.18% מהמקרים הקליניים לעומת 0.02% באוכלוסיית הביקורת הבריאה

שינויים הטרוזיגוטיים נמצאו גם בהורים בריאים, אחים בריאים ובקבוצות ביקורת בריאות

יחס הסיכויים (OR) הוא 10.3, כלומר השינוי מגביר את הסיכון פי 10 בערך, אך אינו גורם ודאי למחלה

גורמים המשפיעים על הביטוי הקליני: [1]

גורמים גנטיים נוספים (מוטציות או CNVs נוספים)

גורמים סביבתיים, במיוחד בתקופה הטרום-לידתית

אירועים סטוכסטיים

נשאים בריאים עשויים להציג תכונות תת-קליניות כמו חרדה, אימפולסיביות, או אינטליגנציה גבולית, אך ללא הפרעה התפתחותית משמעותית. [1]

המלצות

ייעוץ גנטי מפורט - חשוב לברר האם קיימים שינויים גנטיים נוספים בעובר (CNVs או מוטציות אחרות) שעלולים להשפיע על הפרוגנוזה

הערכה נוירופסיכולוגית של האם - למרות שהיא נחשבת בריאה, ייתכנו תכונות תת-קליניות שלא זוהו

מעקב התפתחותי צמוד לאחר הלידה - גילוי מוקדם של סימני אזהרה והתערבות התנהגותית מוקדמת במידת הצורך [1]

לסיכום: לא ניתן לחזות בוודאות את התוצאה הקלינית. הסיכון מוגבר משמעותית לעומת האוכלוסייה הכללית, אך רוב הנשאים של שינויים הטרוזיגוטיים ב-NRXN1 אינם מפתחים הפרעות התפתחותיות חמורות. העובדה שהאם בריאה היא סימן מעודד, אך אינה מבטלת את הסיכון.

- מידע נוסף על הבדיקות הגנטיות המשלימות המומלצות לעובר כדי לשפר את הערכת הסיכון

בדיקות גנטיות משלימות מומלצות לעובר עם שינוי NRXN1:

1. בדיקת האלל השני של NRXN1 (רצף מלא)

חשוב במיוחד - יש לבצע רצף DNA מלא של האלל השני (הבריא) של NRXN1 כדי לשלול מוטציות נקודתיות או הכנסות/מחיקות קטנות מאוד שלא מתגלות בבדיקות CNV רגילות. זה קריטי במיוחד אם העובר יציג לאחר הלידה עיכוב פסיכומוטורי חמור מוקדם בהקשר של תסמונת דמוית Pitt-Hopkins (Pitt-Hopkins-like syndrome 2). [1]

הסבר: מוטציות בי-אללליות (compound heterozygous) ב-NRXN1 גורמות לפנוטיפ חמור הרבה יותר מאשר מוטציות הטרוזיגוטיות בודדות. במקרים כאלה, 53.84% מהחולים סובלים מאפילפסיה עם התקפים מוכללים. [2]

2. Chromosomal Microarray Analysis (CMA) - בדיקת CNVs נוספים

מומלץ מאוד - יש לבצע בדיקת מיקרו-מערך כרומוזומלי מלאה כדי לזהות CNVs (copy number variations) נוספים בגנום שעלולים לשמש כ"מכה שנייה" (second-hit) ולהחמיר את הפנוטיפ. [1][3]

הסבר: מחקרים מראים ש-NRXN1 deletions לבדם לרוב אינם מספיקים לגרום למחלה קלינית. גורמי סיכון גנטיים נוספים פועלים באופן סינרגיסטי עם השינוי ב-NRXN1 ודוחפים את חומרת הפנוטיפ מעל הסף הקליני. נשאי מחיקות אינטרוניות ב-NRXN1 נמצאו פי 2 יותר עם CNV קליני נוסף בהשוואה לנשאי מחיקות אקסוניות. [1]

3. Clinical Exome Sequencing (CES) או Whole Exome Sequencing (WES)

שיקול לבחינה - בדיקת אקסום קליני או מלא יכולה לזהות:

וריאנטים נדירים בגנים נוספים הקשורים להפרעות נוירו-התפתחותיות

וריאנטים בגנים סינפטיים אחרים (כמו NRXN2, NRXN3, NLGN1-4) שעלולים להשפיע על הפנוטיפ [4]

מוטציות נקודתיות שלא מתגלות ב-CMA

4. בדיקת הרקע הגנטי של האם

מומלץ - למרות שהאם נחשבת בריאה, כדאי לשקול:

הערכה נוירופסיכולוגית מפורטת - לזהות תכונות תת-קליניות (חרדה, אימפולסיביות, קשיי למידה קלים)

בדיקת CNVs נוספים אצל האם - כדי לראות אם יש לה גורמי סיכון גנטיים נוספים שלא עברו לעובר (או להיפך)

5. בדיקות ספציפיות לפי סוג השינוי

השינוי c.2792dup הוא מוטציה נקודתית (frameshift) ולא מחיקה. חשוב לדעת:

האם השינוי משפיע על טרנסקריפט α או β של NRXN1

באיזה אקסון השינוי נמצא - מחיקות המערבות אקסונים 1-6 קשורות יותר לאפילפסיה (71.42% עם אפילפסיה גנטית מוכללת) [2]

האם השינוי צפוי לגרום ל-nonsense-mediated decay או לחלבון קטום

סיכום עדיפויות הבדיקות:

רצף מלא של האלל השני של NRXN1 (עדיפות ראשונה)

CMA לזיהוי CNVs נוספים (עדיפות ראשונה)

Clinical/Whole Exome Sequencing (שיקול חזק)

הערכה גנטית והתנהגותית של האם (מומלץ)

הערה חשובה: נשאי מחיקות אינטרוניות ב-NRXN1 נמצאו עם CNV קליני נוסף פי 2 יותר מנשאי מחיקות אקסוניות, מה שמדגיש את החשיבות של חיפוש אחר גורמים גנטיים נוספים.

כדי לקבוע האם השינוי c.2792dup משפיע על טרנסקריפט α או β של NRXN1, יש צורך במידע נוסף על מיקום האקסון המדויק.

המבנה הגנומי של NRXN1:

NRXN1-α: הפרומוטר נמצא לפני אקסון 1, והטרנסקריפט כולל אקסונים 1-24 (או 1-23 בחלק מהאיזופורמים) [1]

NRXN1-β: הפרומוטר נמצא באינטרון 17 של האיזופורם בן 23 האקסונים, והטרנסקריפט הקצר יותר מתחיל מאקסון 18 ואילך [1]

כלל קריטי להבנה:

מוטציות באקסונים 1-17 (לפני הפרומוטר של β) → משפיעות רק על NRXN1-α

מוטציות באקסונים 18-24 (אחרי הפרומוטר של β) → משפיעות גם על α וגם על β

מה צריך לברר:

באיזה אקסון נמצא השינוי c.2792dup?

אם הדוח הגנטי מציין את מספר האקסון, זה יקבע מיד את התשובה

אם לא, יש לבקש מהמעבדה הגנטית לציין זאת

על איזה טרנסקריפט התבססה המספור?

יש מספר טרנסקריפטים שונים של NRXN1 עם מספור אקסונים שונה

חשוב לדעת את מספר הטרנסקריפט (למשל ENST00000404971.5 או NM004801)

משמעות קלינית של ההבדל:

אם השינוי משפיע רק על α:

α-neurexins חיוניים יותר - עכברים ללא α-neurexins מתים ביום הראשון לאחר הלידה, בעוד שעכברים ללא β-neurexins שורדים [1]

α-neurexins מאוד משומרים אבולוציונית, בעוד ש-β-neurexins פחות [1]

פוטנציאל לחומרה גבוהה יותר

אם השינוי משפיע גם על β:

משפיע על שני האיזופורמים

עלול להיות השפעה רחבה יותר על תפקוד הסינפסה

α ו-β יש תפקידים שונים בהעברה סינפטית בגלל דפוסי אינטראקציה שונים עם ליגנדים [1]

המלצה מעשית:

צור קשר עם המעבדה הגנטית ובקש:

מספר האקסון המדויק שבו נמצא c.2792dup

מספר הטרנסקריפט שעליו התבסס המספור

האם השינוי צפוי להשפיע על α בלבד או גם על β

מידע זה קריטי להערכת הסיכון ולתכנון המעקב ההתפתחותי.

האם יש לך גישה לדוח הגנטי המלא שבו מצוין מספר האקסון?