גנים חדשים
מתוך Genopedia - פרופ' מוטי שוחט
| גרסה מתאריך 20:36, 18 ביוני 2026 (עריכה) Motti (שיחה | תרומות) (דף חדש: זהו נושא שמעניין במיוחד גנטיקאים קליניים, אבל חשוב לציין שכאשר אומרים “גנים חדשים שדווחו השנה”, רובם...) → עבור להשוואת הגרסאות הקודמת |
גרסה מתאריך 20:41, 18 ביוני 2026 (עריכה) (ביטול) Motti (שיחה | תרומות) עבור להשוואת הגרסאות הבאה ← |
||
| שורה 132: | שורה 132: | ||
| אך לא נראה שהיה השנה “SCN2A חדש” או “DDX3X חדש” בתחום זה. | אך לא נראה שהיה השנה “SCN2A חדש” או “DDX3X חדש” בתחום זה. | ||
| + | מה היה הטרנד החשוב ביותר? | ||
| + | |||
| + | לא גן מסוים אלא שינוי תפיסתי: | ||
| + | |||
| + | לפני 5 שנים רוב הגנים החדשים התגלו באמצעות Exome. | ||
| + | |||
| + | ב־2026 רוב הגנים החדשים בעלי העניין התגלו באמצעות: | ||
| + | |||
| + | 1. Whole Genome Sequencing | ||
| + | 2. Long-read Sequencing | ||
| + | 3. RNA Sequencing | ||
| + | 4. Methylation Profiling | ||
| + | 5. Functional Genomics | ||
| + | |||
| + | למי שעוסק בילדים עם לקות אינטלקטואלית, אוטיזם ואנצפלופתיות התפתחותיות, התחושה מהכנס הייתה שאנו נכנסים לעידן שבו חלק ניכר מהגנים החדשים לא יימצאו באקסונים אלא במנגנוני בקרה, RNA לא־מקודד וארגון כרומטין. | ||
גרסה מתאריך 20:41, 18 ביוני 2026
זהו נושא שמעניין במיוחד גנטיקאים קליניים, אבל חשוב לציין שכאשר אומרים “גנים חדשים שדווחו השנה”, רובם עדיין בשלב של gene-disease association ראשונית, וחלקם טרם עברו ולידציה מלאה.
ב־ESHG 2026 ניכר מעבר מגילוי גנים בודדים לגילוי באמצעות:
- Long-read sequencing
- RNA-seq
- Multi-omics
- Functional genomics
- AI-assisted gene discovery
התחום הפעיל ביותר היה ללא ספק Neurodevelopmental Disorders (NDD).
1. NPTN – מועמד חזק להפרעה נוירו־התפתחותית חדשה
אחד המושבים הבולטים עסק בגן NPTN (Neuroplastin).
הוצגה סדרת חולים עם וריאנטים דה־נובו ב־NPTN שכללה:
- פיגור התפתחותי
- לקות אינטלקטואלית
- הפרעות שפה
- מאפיינים אוטיסטיים בחלק מהחולים
העבודה כללה גם ולידציה פונקציונלית שהראתה פגיעה במסלול Neuroplastin–PMCA. זהו אחד הגנים החדשים המשכנעים ביותר שהוצגו בתחום ה־NDD השנה.
משמעות מעשית
אם אתה נתקל ב־VUS ב־NPTN אצל ילד עם DD/ID, הסבירות שהגן יהפוך לגן מחלה מבוסס בעתיד הקרוב נראית גבוהה.
⸻
2. RNU2-2P ו־RNU5B-1
אחת ההפתעות של הכנס הייתה גילוי גנים לא־מקודדים (non-coding genes) הגורמים להפרעות נוירו־התפתחותיות.
הוצגה עבודה שהראתה כי וריאנטים ב:
- RNU2-2P
- RNU5B-1
קשורים לפנוטיפ נוירו־התפתחותי משמעותי.
למה זה חשוב?
במשך שנים התמקדנו בעיקר באקסונים.
המסר מהכנס היה שיותר ויותר מחלות נדירות יאותרו בעתיד באזורים:
- intronic
- regulatory
- non-coding RNA
ולכן היתרון של WGS על פני WES רק הולך וגדל.
⸻
3. גנים חדשים במחלות הקשורות לספלייסוזום
הייתה סדרה של עבודות על מחלות הקשורות ל־snRNA ולמרכיבי spliceosome.
התחום מזכיר את ההתפתחות שחווינו עם:
- RNU4ATAC
- RNU4-2
- RNU5A
כעת מתחילים להופיע גנים לא־מקודדים נוספים עם פנוטיפים של:
- ID
- מיקרוצפליה
- מומים מולדים
⸻
4. גל חדש של גנים ב־Chromatinopathies
לא הוצג “גן אחד גדול”, אלא מספר גנים חדשים במנגנוני:
- chromatin remodeling
- histone modification
- epigenetic regulation
המסר היה שתחום זה ממשיך להיות מקור מרכזי לגילוי תסמונות חדשות.
⸻
5. גנים חדשים שהתגלו באמצעות RNA-seq
כמה קבוצות הציגו משפחות שבהן:
- Exome היה תקין
- Genome היה לא חד־משמעי
- RNA-seq חשף פגיעה בספלייסינג
בחלק מהמקרים התגלו גנים חדשים לחלוטין.
התחושה בכנס הייתה ש־RNA-seq הופך כיום לכלי המרכזי הבא לגילוי גנים חדשים.
⸻
6. גנים חדשים שהתגלו באמצעות Long-read sequencing
מספר קבוצות הראו ש־Long-read מאפשר גילוי של:
- repeat expansions חדשות
- rearrangements מורכבים
- cryptic structural variants
בכמה מהמשפחות זוהו gene-disease associations שלא ניתן היה לזהות כלל באמצעות Exome.
⸻
7. גנים חדשים במחלות שלד
בתחום הדיספלזיות והפרעות שלד הוצגו מספר משפחות חדשות עם גנים הקשורים ל:
- ossification
- extracellular matrix
- growth plate biology
חלקם עדיין בשלב מוקדם מאוד ולא צפויים להיכנס מיד לפאנלים מסחריים.
⸻
8. גנים חדשים במומי לב מולדים
נמשך זרם הגילויים של גנים הקשורים ל:
- congenital heart disease
- left-right patterning
- cardiac transcription factors
אך לא נראה שהיה השנה “SCN2A חדש” או “DDX3X חדש” בתחום זה. מה היה הטרנד החשוב ביותר?
לא גן מסוים אלא שינוי תפיסתי:
לפני 5 שנים רוב הגנים החדשים התגלו באמצעות Exome.
ב־2026 רוב הגנים החדשים בעלי העניין התגלו באמצעות:
1. Whole Genome Sequencing 2. Long-read Sequencing 3. RNA Sequencing 4. Methylation Profiling 5. Functional Genomics
למי שעוסק בילדים עם לקות אינטלקטואלית, אוטיזם ואנצפלופתיות התפתחותיות, התחושה מהכנס הייתה שאנו נכנסים לעידן שבו חלק ניכר מהגנים החדשים לא יימצאו באקסונים אלא במנגנוני בקרה, RNA לא־מקודד וארגון כרומטין.
